Hedwig nació varón, un chico llamado Hansel que soñaba con encontrar su otra mitad, pero de mala gana se sometió a una operación de cambio de sexo que le permitió casarse con un soldado americano y alcanzar la libertad al otro lado del muro de Berlín. La operación salió mal y Hedwig se quedó con esa "pulgada irritada" que da nombre a la película. Abandonada y divorciada en un parque de caravanas de Kansas "ella" decide formar un grupo de rock y conoce al joven Tommy Gnosi, que se convierte en su amante y protegido antes de abandonarla, robarle sus canciones y triunfar por todo lo alto como estrella del rock. Acompañada de su grupo paneslavo, "The Angry Inch", Hedwig, afligida pero divertida, sigue a Tommy en su gira de masas tocando en restaurantes medio vacíos ante clientes desconcertados y unos cuantos fans incondicionales..

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